产品信息
[产品供应]

STR/SSR/微卫星分析

产品货号: STR
供应商: 北京瑞金特生物科技有限公司
产品产地: 北京
参考价格: 8 元
销售区域: 全国
使用范围: 仅为制药设备或原料、科研使用,不能直接做用于人
产品参数
产品名: STR/SSR/微卫星分析
英文名:  
销售分类: 生物技术服务 > STR/SSR/微卫星分析 型号/货号: STR
产地: 北京 商标:
销售地区: 全国 价格: 8 元
产品特性: 利用ABI测序仪对荧光标记的DN**段进行检测,结合分子量内标进行DN**段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确。
信息有效期: [长期有效]    [更新时间:2012-2-27 20:02:17 ]
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STR/SSR/微卫星分析

服务编号
服务项目
内容说明
价格
周期
STR01
STR引物开发
开发未知基因组序列物种的引物
询价
2-4
STR02
STR引物筛选
筛选适合荧光检测的引物
询价
2-4周
STR03
引物设计与合成
荧光标记引物
询价
1周
STR04
PCR条件优化
单重和多重PCR
询价
1-2周
STR05
PCR扩增
荧光或非荧光
询价
1-4周
STR06
测序仪检测
用测序仪对单色或多色荧光标记DN**段进行分离和检测
询价
2-7工作日
STR07
原始数据分析
将原始数据分析为基因型
询价
1工作日- 2周
STR08
群体遗传学分析
关联分析、连锁图构建等
询价
1-2周
STR09
AFLP检测
检测和数据分析
询价
2-5工作日

 
背景介绍
微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加***显影或银染的方法,费时费力效率低。瑞金特利用ABI测序仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确。
服务项目:
1.     STR引物开发
通过富集微卫星序列,开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列,并且对序列进行多态性和特异性验证。
2.     引物筛选
选取部分代表性样本,利用普通引物进行PCR扩增,然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息(图1)。
1 用岛津MultiNA芯片电泳仪进行引物筛选的结果
3.     样本批量扩增
用带有荧光标记(FAMHEXTMRROX等)的引物,对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR扩增平台,可以满足大量样本扩增需求。
4.     测序仪检测
带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合,用3730xl等测序仪进行毛细管电泳,并得到原始数据(fsa文件,见图2)。
2 应用3730xl测序仪检测得到的原始图谱
5.     原始数据分析
编制panelbin等文件,使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件,并生成PDF图谱和Excel文档(包括size、基因分型等信息),分析后的电泳图谱见图3
3 GeneMapper软件分析后的电泳图谱
6.     群体遗传学分析
利用生物信息学软件(POPGENEMEGAPHYLIPARLEQUIN等)对上述数据进行进一步分析,绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。
送样要求:
细胞(≥106)、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(体积≥20μl,浓度≥ 50 ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。
提供结果:
引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。
成功案例:
到目前为止,我公司与上百家科研机构建立合作,进行过多个物种的引物开发、多态性分析、种系鉴定和连锁图谱构建等工作,包括人、小鼠、大鼠、兔、马、犬、牛、大熊猫、鱼、虾、麻雀、蜜蜂、蚊子、蚜虫、瓢虫、小麦、玉米、大豆、棉花、杨树、苹果、葡萄和真菌等。
 

相关技术服务
服务编号
服务项目
内容说明
EXT01
DNA提取
从组织材料或血液等样本材料中提取基因组DNA,可应用液体工作站进行批量处理

 
 

相关产品
名称
品牌
规格
说明
微卫星文库构建试剂盒
 
5次
磁珠法,速度快,成功率高
多重PCR复合扩增体系
 
100/500次
专用于多重PCR的复合扩增体系,可实现10重以上扩增
血液直接扩增体系
 
100/500次
具有极强的抵抗抑制剂能力,直接从血液中扩增基因片段而且特异性优秀
植物叶片直接扩增体系
 
100/500次
直接从叶片中扩增DNA,省时省力
Blood PCR Mix A
 
500/1000 rnx
直接从血液中扩增基因片段
Blood PCR Mix B
 
500/1000 rnx
热启动Taq酶
 
250/500/1000U,2.5U/μl
化学修饰,热启动,特异性极好,性价比很高
2G Fast DNA聚合酶
 
100/250/500U
经过基因工程改造,快速PCR,30分钟完成扩增;抵抗抑制剂能力超强
2G Fast DNA聚合酶(热启动)
 
100/250/500U
2G Robust DNA聚合酶
 
100/250/500U
经过基因工程改造,极强的抗复杂模板能力,适合高GC含量
2G Robust DNA聚合酶(热启动)
 
100/250/500U
高保真DNA聚合酶
 
100/250/500U
高度保真性,抵抗抑制剂
高保真DNA聚合酶(热启动)
 
100/250/500U
基因组DNA提取试剂盒
 
50/100次
离心柱型,纯度更高
DNA快速提取试剂
 
50/100/250/500次
20分钟完成提取,操作简便
ROX 500分子量内标
 
500/1000次
70-500bp
LIZ 500分子量内标
 
500/1000次
35-500bp
POP4胶
 
7ml
3130/3100系列测序仪用
POP7胶
 
28ml
3730系列测序仪用
310毛细管
 
47cm,5根
基因分型用

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